> Er war entrüstet, ja sogar beleidigt.
> Er war entrüstet, ja, sogar beleidigt.
> Was bitte ist richtig?
Beides ist richtig, je nach dem, wie du das "ja" aufgefasst haben willst.
Möchtest du das "ja" als Einwurf/Ausruf verstanden wissen, dann ist die zweite Variante richtig.
Beim ersten Satz möchtest du das "ja" als Verstärkung zum "sogar" einsetzen, dann kommt danach kein Komma.
Gruß Antonia