Richtig ist die Schreibweise:
"Dabei erniedrigte sich die Rechnung um 3 Prozent[,] und das, obwohl es keiner glauben wollte."
Die eckigen Klammern bedeuten, dass das Komma auch weggelassen werden kann.
Tipp: Wenn Du anstelle von "das" auch "dieses" oder "jenes" oder "welches" einsetzen kannst, schreibt es sich mit einfachem s, ansonsten mit ss.
Grüße
Julian