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So ganz kann ich Andreas nicht recht geben, da "Onkels als" eben auch betont, dass der Widerstand vom Onkel IN SEINER ROLLE ALS Vorstandsvorsitzender geleistet wurde.

Zum Thema findest du im grünen Duden etwas unter "Apposition", 3.3:
Hat die an einen attributiven Genitiv angeschlossene Konjunktionalgruppe mit als keinen Artikel bei sich, dann steht sie gewöhnlich im Nominativ (nur bei Ausdrücken mit attributivem Adjektiv kommt gelegentlich auch der Genitiv vor):
© Duden - Richtiges und gutes Deutsch, 7. Aufl. Mannheim 2011 [CD-ROM]

Da wir hier ein attributives Adjektiv vorliegen haben, ist also sicher beides richtig:

Er scheiterte am Widerstand seines Onkels als damaliger Vorsitzender des Vorstands.
Er scheiterte am Widerstand seines Onkels als damaligen Vorsitzenden des Vorstands.

Da hier aber, wie du richtig bemerkst, der Genitiv ohnehin nur schwer erkennbar ist, würde ich gleich bei der Nominativform bleiben. Den Dativ würde ich ausschließen.

Gruß
Julian