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Der (meistens nicht vorhandene) Unterschied zwischen "funktional" und "funktionell" wird im entsprechenden Duden-Beitrag zu richtigem und gutem Deutsch deutlich:

Die Bedeutung "auf die Funktion bezogen" haben beide Wörter gemeinsam: nach funktionalen/funktionellen Prinzipien.
Im Sinne von "wirksam" und (medizinisch) "die Leistungsfähigkeit eines Organs betreffend" kann jedoch nur funktionell verwendet werden: funktionelle Störungen, Erkrankungen.

Mit "funktionell" macht man also nie etwas verkehrt, wohingegen "funktional" nicht immer funktioniert.