So:
Der Käpt’n nickte, machte eine Handbewegung mit Seitenblick(,) hin zu einem Untergebenen - das war vielleicht sein Bootsmann oder Erster Offizier.
Oder mit Komma:
Der Käpt’n nickte, machte eine Handbewegung mit Seitenblick(,) hin zu einem Untergebenen, das war vielleicht sein Bootsmann oder Erster Offizier.