> Muss ich hier alles durchkoppeln?
Ja!
> Welche Wörter schreibe ich groß, welche klein?
Substantive schreibst du groß und, wenn das Gesamtkompositum ein Substantiv ist, auch den ersten Buchstaben eines Nicht-Substantivs, also:
Green-fluorescent-Protein
Drive-in-Counter
Single-Chain-Fragment
Entweder, du koppelst alles mit Bindestrichen oder du schreibst alles zusammen oder teilweise zusammen, teilweise mit Bindestrich(en).
Vgl.: Cornedbeefbüchse in allen Variationen
http://canoonet.eu/spelling/corned-beef-b%C3%BCchse:N:F
https://www.korrekturen.de/suche/searcher.php?q=Cornedbeef